La CEP tiene sus oficinas centrales en:
1706 Calle Pumarada, Santurce, Puerto Rico

Dirección postal: PO Box 40682, Minillas Station,
San Juan, PR 00940-1654
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La Conferencia Episcopal Puertorriqueña está compuesta por los Obispos de la Provincia Eclesiástica de Puerto Rico. La competencia de la Conferencia está regida por normas dadas por la Santa Sede. El Código de Derecho Canónico legisla sobre las disposiciones que, como Conferencia, regirán cuando el Derecho Universal de la Iglesia así lo disponga. En el caso de la CEP, el Decreto sobre las Normas Complementarias al CIC de 1983, con fecha del 13 de mayo de 1987 especificó los cánones sobre los cuales todos los Obispos de Puerto Rico han de estar de acuerdo y gracias a los cuales, hay uniformidad en todas las Diócesis actuales y por crearse en nuestra Provincia.

La Asamblea Plenaria de la CEP, a la cual también se invita al Legado Apostólico (sea el Delegado o el Nuncio), se celebra una vez al año, a finales de noviembre. Allí se elige la Presidencia y Vicepresidencia, cargos que se desempeñan por tres (3) años. También se nombran las Comisiones Permanentes, que son asignadas a los distintos Obispos de la Isla, para supervisar, reunir y sugerir pistas comunes. Además, hay una Comisión Permanente que se reúne con más frecuencia que la Asamblea Ordinaria. El Obispo Secretario General ocupa el cargo por cuatro (4) años.
Presidente
SER Mons. Rubén González CMF
Obispo de Caguas Vicepresidente
SER Mons. Félix Lázaro SchP
Obispo de Ponce

Secretario General
SER Mons. Daniel Fernández
Obispo Auxiliar de San Juan Tesorero
Mons. Hermín Negrón
Obispo Auxiliar de San Juan

Delegado del CELAM
SER Mons. Rubén González Medina CMF
Obispo de Caguas Secretaria Ejecutiva
Sor Juanita Rosa Ortiz Montes OP